随着马英九走马上任，两岸经贸往来成为投资者最为关注的问题。在5月于台北举办的一个有关创投的论坛上，投资者纷纷看好投资台湾的市场前景，以及其对于投资大陆的先行作用。他们认为，进入大陆投资倍受限制的私募基金，可望因为两岸开放在即以及马英九承诺松绑台商赴大陆投资的净值40%的上限规定，而找到向大陆前进的快捷方式，即通过投资台湾绕道前行。

“大选之后，私募股权与创业投资者们看到了与两岸业界沟通合作的更多机会，大陆的地产投资者更是先行探路寻找台湾的投资良机。可见除了市场和技术外，两岸的互动也将通过资本流通的方式先行。”本次论坛主办者亚洲创业投资期刊（AVCJ）执行总编麦金托什（Paul Mackintosh）如是说。

根据AVCJ Research的数据：2006年台湾的私募股权投资已达40亿美元，2007年更达49亿美元；与2006年之前的五年总共只有30亿美元投资的情况相比，成长幅度惊人，凸显了私募股权基金在台湾市场的热络。

两岸互通带来的资金流动也可以一补岛内创投业面临的资金不足的窘境。根据创投公会的研究，2001-2006年台湾新增创投家数锐减，2006年创投业资金流出剧增，实际净流出金额高达146.7亿元新台币。如此情景亟需台湾创投业者在发挥专长之余，拓宽国际视角和市场广度，向国际结盟的方向迈进。而两岸开放带来的大陆资金对于台湾创投业就是很好的机会。

台湾实业界对于两岸互通也颇为振奋。台湾电机电子工业同业公会理事长焦佑钧表示，更加开放的两岸关系将为两岸的电机电子业制造机会，以便结合台湾的通讯技术和大陆的市场，创造出更多大中华区公认的品牌。